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簡要描述:蛋白質(zhì)鑒定以及定量服務(wù)是應(yīng)用質(zhì)譜技術(shù)結(jié)合不同的分析平臺,對樣本中的蛋白質(zhì)進(jìn)行精確的鑒定和定量分析。
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項(xiàng)目背景:
隨著組學(xué)技術(shù)的發(fā)展,蛋白質(zhì)組學(xué)已經(jīng)成生命科學(xué)研究中的重要分支。在研究復(fù)雜生物樣本中的蛋白質(zhì)時(shí),僅僅通過傳統(tǒng)的分子生物學(xué)技術(shù)已經(jīng)無法滿足研究的需要。質(zhì)譜技術(shù)(Mass Spectrometry, MS)因其高靈敏度和高精度等優(yōu)點(diǎn),成為蛋白質(zhì)研究中的重要工具,特別是最近幾十年里,質(zhì)譜技術(shù)在蛋白質(zhì)鑒定以及定量服務(wù)中的應(yīng)用更是得到了迅猛發(fā)展。
蛋白質(zhì)鑒定的目的是確定樣本中存在哪些蛋白質(zhì),并獲取其序列信息。質(zhì)譜技術(shù)可以準(zhǔn)確地測定蛋白質(zhì)或多肽的分子量,從而推定其氨基酸序列信息。在蛋白質(zhì)鑒定的實(shí)驗(yàn)流程中,經(jīng)常利用液相色譜(LC)與質(zhì)譜(MS/MS)聯(lián)用的技術(shù),如LC-MS/MS,來分析和鑒定膠點(diǎn)或膠條中的蛋白質(zhì)。
蛋白質(zhì)定量分析則關(guān)注的是蛋白質(zhì)的表達(dá)水平。質(zhì)譜技術(shù)可以通過對特定肽段的信號強(qiáng)度進(jìn)行測量,來計(jì)算蛋白質(zhì)的相對或絕對濃度。標(biāo)記定量方法,例如iTRAQ/TMT,通過特異性的標(biāo)簽來區(qū)分和量化不同樣本中的蛋白質(zhì)。非標(biāo)記定量方法(Label-free)則不依賴標(biāo)簽,而是通過比較質(zhì)譜信號強(qiáng)度來定量蛋白質(zhì)。
此外,還有諸如基于抗體的PRM(平行反應(yīng)監(jiān)測)技術(shù),可用于特定蛋白質(zhì)的靶向定量研究;而基于翻譯后修飾(如磷酸化、甲基化)的研究則可以揭示蛋白質(zhì)的功能調(diào)控情況。
總的來說,蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域的這些技術(shù)服務(wù),不僅能夠應(yīng)用于蛋白質(zhì)鑒定以及定量服務(wù),還可以揭示其動態(tài)變化和相互作用,為疾病機(jī)理研究、生物標(biāo)志物的篩選、藥物靶點(diǎn)的發(fā)現(xiàn)和驗(yàn)證等領(lǐng)域提供了強(qiáng)有力的支持。隨著分析技術(shù)的持續(xù)進(jìn)步和創(chuàng)新,未來蛋白質(zhì)組學(xué)的應(yīng)用前景將更加廣闊。
案例展示:
質(zhì)譜用于互作蛋白質(zhì)鑒定(CoIP樣本)
定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)
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